ÖZ

Amaç

Blastocystis sp. hem insanları hem de hayvanları enfekte edebilen intestinal yerleşimli bir Stramenopil türü olarak sınıflandırılmaktadır. Genetik çeşitliliği farklı moleküler yöntemlerle araştırılmış ve çok sayıda alt tipi (ST) tanımlanmıştır. Bu çalışmada insan dışkısı örneklerinde en yaygın saptanan Blastocystis sp. ST olan ST3’e özgü mikrosatelit lokusların karakterizasyonu ve popülasyon yapısının belirlenmesi amaçlanmıştır.

Yöntemler

Blastocystis sp. ST3’ün tüm genom dizisi taranarak en az sekiz tekrarlı mikrosatelit lokusları belirlenmiştir. Her bir lokusa spesifik primerler dizayn edilmiş ve polimorfizmler biyoinformatik araçlar ile analiz edilmiştir. Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Hastanesi rutin laboratuvarından elde edilen 18 Blastocystis sp. ST3 genomik DNA örneği kullanılarak popülasyon yapısı belirlenmiş ve mikrosatelit tiplendirme gerçekleştirilmiştir.

Bulgular

Blastocystis sp. ST3 tüm genom taraması sonucu en az sekiz tekrarlı 12 mikrosatelit lokusu tespit edilmiştir. Dizayn edilen primerler ile lokusların tümü başarıyla amplifiye edilmiş ve bunlardan sekizi genotiplendirmede kullanılmak üzere seçilmiştir. Blastocystis sp. ST3 izolatları mikrosatelit polimorfizmlerine göre tiplendirildiğinde her bir izolat farklı bir profil (18 izolat, 18 farklı mikrosatelit tipi) göstermiştir. Ayrıca izolatların iki ayrı popülasyon grubunda toplandığı saptanmıştır.

Sonuç

Blastocystis sp. ST3 izolatlarının mikrosatelit tekrarları açısından birbirlerinden oldukça farklı bir yapıya sahip oldukları belirlenmiştir. Polimorfik mikrosatelit lokusları, Blastocystis sp. ST3 izolatlarının detaylı genotiplendirilmesine ve popülasyon yapılarının araştırılmasına olanak sağlayan yeni bir yaklaşım olarak görülmektedir.